Уханьский, британский или индийский: чем отличаются штаммы ковида и что важно о них знать
Уровень заболеваемости коронавирусом в Северной столице увеличивается — только за 25 июня 22 тысячи раз взволнованные горожане позвонили в единую региональную информационно-справочную службу с вопросами о ковиде, рассказали в пресс-службе правительства города. Почти 1,2 тысячи случаев заражения выявили за минувшие сутки, тогда как днем ранее — 1 143.
Новый всплеск ковида, начавшийся два месяца назад, обусловлен новым штаммом дельта в Петербурге. Впервые он был обнаружен в Индии осенью 2020 года, а в Северную столицу дошел весной 2021-го. Число летальных исходов стало расти: за май умерли 1 098 человек, а за июнь — 1 507, сообщается на сайте coronavirusstat.ru. За последнюю неделю в Петербурге зафиксировано 632 летальных исхода, неделей раньше — 418.
Специалисты утверждают, что 90 % болеющих ковидом — жертвы нового, индийского штамма, остальные 10 % заболеваний приходятся на предшествующие разновидности коронавируса.
НЕВСКИЕ НОВОСТИ рассказывают о различиях в симптомах трех выявленных видов коронавируса в Петербурге.
Уханьский вирус
По официальной версии китайских властей, первые заболевшие коронавирусом были посетителями рыбного рынка в городе Ухань в ноябре 2019 года. Согласно неофициальной версии, этот ковид пришел к нам не из Китая, а его завезли российские туристы из Италии.
Уханьский вирус — острая респираторная вирусная инфекция, характеризующаяся сходными симптомами с ОРВИ. Однако он может протекать в более тяжелой форме, нежели другие, более легкие вирусы, приводя к тяжелым осложнениям и даже смерти.
Коронавирус проникает в организм человека через носовую и ротовую полости, слизистую глаз и, когда достигает легких, провоцирует у большинства обширный воспалительный процесс.
Симптомы уханьского ковида
Наиболее распространенными симптомами ковида были незначительное повышение температуры, сухой кашель и повышенная утомляемость.
Возможными проявлениями вируса являются внезапная потеря обоняния и/или вкуса, заложенность носа или умеренная ринорея, конъюнктивит или покраснение глаз, боль в горле, головные боли, головокружения. Однако те, кто перенес заражение ковидом в легкой форме, сравнивают ощущения с обычной простудой.
У пациентов старше 65 лет часто наблюдалась нетипичная картина заболевания, которая заключалась в помутнении сознания, нарушениях речи, двигательных расстройствах, а также более тяжелых осложнениях — инсультах и воспалительных поражениях мозга.
Легкое течение болезни часто переходит в среднюю и тяжелую степени — ковид поражает не только легкие, приводя их к отеку и острой дыхательной недостаточности, но и другие органы и системы организма.
Британский вирус
Второй штамм коронавируса — британский — пришел к нам из Великобритании и проявился в Петербурге весной 2021 года. Таким образом, вспышка заболевания в городе протекала сразу с двумя разновидностями ковида.
О новом варианте ковида власти Великобритании стали говорить в конце декабря 2020 года, но британские медики уверяют, что Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) обнаружила новый штамм коронавируса еще в сентябре.
На момент обнаружения нового штамма ковида Москву и Лондон связывали 20 прямых рейсов в неделю, но 22 декабря наша страна на неделю приостановила все рейсы из Туманного Альбиона.
В начале января Роспотребнадзор сообщил о первом случае нового штамма коронавируса. Главный государственный санитарный врач Анна Попова уточнила, что его обладатель прибыл из Великобритании, чувствует себя хорошо и симптомов болезни у него нет. Однако «мутанту» понадобилось всего несколько месяцев, чтобы сместить уханьский ковид с лидирующих позиций.
Симптомы «британца»
Аллерголог-иммунолог Надежда Логина рассказала, что главное отличие британского штамма от уханьского заключается в потере обоняния.
«Боль в грудной клетке, кашель, температура, першение в горле, нарушение обоняния, нарушение восприятия вкуса, затруднение дыхания», — перечислила эксперт.
При заболевании уханьским штаммом поражаются как дыхательная, так и сосудистая системы организма. В этой вариации коронавируса иногда появляются проблемы с желудочно-кишечным трактом.
Заболевание начинается внезапно и развивается стремительно. Появляется сильная слабость и головная боль, и спустя некоторое время симптомы нарастают. Признаки поражения органов дыхания появляются не всегда — вирус «садится» там, где имеются наиболее ослабленные места.
Этому штамму подвержены дети — у 83 % из них происходят кожно-слизистые изменения: краснеют и опухают глаза, язык, щеки и ладони. Однако поражение внутренних органов происходит редко — только в самых тяжелых случаях. Тогда воспалительный процесс локализуется в кровеносных сосудах, легких и сердце, но могут поражаться и другие системы организма.
Течение ковида у несовершеннолетних происходит постепенно: в течение нескольких дней или недель держится температура, потом на теле появляются специфические зудящие высыпания и сильная одышка.
Индийский вирус
Нынешняя вспышка в Петербурге, начавшаяся в мае, была вызвана штаммом дельта, который шел к нам из Индии с осени 2020 года. Врач иммунолог-аллерголог Владимир Болибок рассказал, что особенность «индийца» заключается в его молниеносной заражаемости.
Новый вариант ковида имеет свои вирусологические характеристики и отличается от предыдущих тем, что одновременно поражаются и легкие, и органы желудочно-кишечного тракта.
«Все это происходит достаточно быстро. Когда такое сочетание, тут сразу человек впадает в тяжелое состояние, а часто погибает», — рассказал эксперт.
Как отметил директор Всеиндийского института медицинских наук Рандип Гулерия, подхватить инфекцию в случае с новым ковидом не составит труда. Для этого достаточно пройти мимо зараженного человека без маски.
Даже если население будет соблюдать все эпидемиологические меры, индийский штамм все равно вызывает особое опасение властей. Все дело в том, что мутация этого штамма устойчива к антителам и имеет свойство «обходить» иммунитет стороной, пишет РИА Новости со ссылкой на портал India Today.
Симптомы «индийца»
Первые признаки заражения штаммом дельта чаще всего выражаются в желудочном колите: рвоте, поносе и сильных болях в животе. Они продолжают мучить человека несколько дней, ему становится только хуже, после чего добавляется воспаление легких.
«Люди думают, что у них отравление, начинают лечиться, как от отравления, потом начинаются уже тромбозы и поражаются легкие», — пояснил Болибок.
По мнению специалиста, при такой стадии развития заболевания человека уже можно не спасти, потому что индийский штамм развивается очень быстро. Именно поэтому врачи настоятельно рекомендуют при любых симптомах сразу же обратиться к врачу, а в случае более запущенной болезни — вызвать скорую.
Подводим итог
Один вид штамма от другого порой отличить проблематично — симптоматика может быть смазанной, ведь течение болезни зависит от особенностей организма.
«Все штаммы коронавируса опасны; насколько тяжело будет протекать инфекция, зависит не только от активности вируса, но и от состояния иммунитета даже в большей стадии, чем от самого пациента», — считает Надежда Логина.
Одни специалисты утверждают, что мутация вируса совсем не предполагает новые, более агрессивные формы ковида, однако реальность подтверждает опасения другой части экспертов, которые считают, что мутация усугубляет процесс заболевания и серьезность осложнений.
До тех пор пока петербуржцы игнорируют рекомендации властей о вакцинации и соблюдении эпидемиологических мер безопасности, инфекция будет развиваться и мутировать, а это может привести к новым штаммам и необратимым последствиям.
Ранее НЕВСКИЕ НОВОСТИ писали, что вакцины от ковида могут не защитить от индийского штамма.
«У меня новый штамм коронавируса»: как диагностировать заражение
Обычными методами мутанта не выявить
Новый британский суперзаразный штамм коронавируса успел наделать шуму и всех перепугать. Нас уверяют, что в России он еще не обнаружен, но вопрос в том, как его обнаруживают, как понять, что это именно тот самый страшный штамм, а никакой иной SARS-CoV-2. Мы выясняли, как можно диагностировать заражение новым штаммом.
Новая мутация распространяется стремительно: по данным британцев, со скоростью, на 70% выше скорости распространения предыдущих штаммов. С момента первого его обнаружения в сентябре, к ноябрю им была вызвана уже четверть случаев заболеваний в Лондоне. В середине декабря количество таких случаев составило не менее двух третей, а в некоторых районах страны – почти 80%.
Разумеется, по обычному исследованию мазков (ПЦР) определить, инфицирован ли человек новым британским штаммом или нет, пока невозможно. Для этого нужно проводить более точное исследование секвенирования генома вируса, что делается в исключительных случаях (например, если есть подозрение, что пациент заболел повторно, да и то далеко не всегда). Так, по оценкам известного американского эпидемиолога Михаила Фаворова, в США секвенирование проведено лишь в 17 тысячах случаев из 51 миллиона.
Как рассказал в своей соцсети Михаил Фаворов, SARS-CoV-2 регулярно мутирует, приобретая около одной новой мутации в геноме каждые две недели. С ноября 2020 года новый штамм стал распространяться на юго-востоке Англии. Как отмечает Фаворов, если использовать тесты, полимеразной цепной реакцией (ПЦР), основанные на выявлении только последовательности S-белка, или, только на основе части S-белка, то тест может быть существенно менее чувствительным.
Однако большинство коммерческих тестов ПЦР имеют последовательности из разных частей генома вируса для обнаружения РНК, так что даже если мутация затрагивает одну из целей, другие цели ПЦР все равно должны работать.
О том, что новая мутация пока не дошла до России, на прошлой неделе заявила глава Роспотребнадзора Анна Попова. Британского штамма в России нет, отчитались и ученые новосибирского центра «Вектор».
Как рассказал обозревателю «МК» ведущий эксперт Центра молекулярной диагностики ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора Михаил Лебедев, его институт уже приступил к разработке новой тест-системы (тоже ПЦР), которая сможет выявлять новый штамм: «Как, например, есть тесты, которые выявляют просто грипп А, а есть те, которые нацелены на выявление его опасного штамма АH1N1. Хотя надо сказать, что существующие тест-системы вполне эффективны в выявлении генетического материала нового штамма коронавируса».
Лебедев говорит, что для начала нужно понять, стоит ли проводить массовое тестирование нового штамма, или это бессмысленно: «Есть данные, что наличие данного штамма никак не влияет на течение заболевания и на его лечение. По сути, его выявление ничего не изменит в протоколах лечения. Работа над новой тест-системой ведется, однако пока неизвестно, будет ли в ней необходимость. Будем надеться, что нет. И что новый штамм окажется просто очередным».
Доктор медицинских наук, профессор, заместитель директора по научной работе Медицинского научно-образовательного центра МГУ Симон Мацкеплишвили сообщил в соцсети, что это уже далеко не первая мутация: «На сегодняшний день описано более 100 тысяч мутаций вируса SARS-CoV-2, из них – примерно 4 тысяч в том самом S-белке. Поэтому думаю, что и в этот раз можно особо не переживать. На сегодняшний день у нас нет никаких доказательств значимого изменения клинического течения заболевания, ни в сторону улучшения, ни в сторону ухудшения. Да, увеличение заразности может увеличить количество больных, но, как я думаю, карантинные меры вполне способны это компенсировать. Если же говорить об увеличении летальности от нового варианта коронавируса – этого тоже не произошло, она и сейчас не превышает четырех погибших на тысячу заболевших людей».
Коварный и опасный: как распознать и лечить индийский штамм COVID-19, который уже в России и на подходе к Украине
Что это за «Дельта» такая?
Повышенное внимание сейчас приковано к последнему из-за стремительного распространения — его выявили в 92 странах, то есть им охвачено полмира, он вытесняет другие штаммы (на «Дельту» приходится 99% новых случаев в Великобритании, 90% — в Москве, 56% — в Астане; 23 июня объявлено о выявлении этого штамма в Минске; на Украине, по оценке Национальной академии наук, он появится осенью).
Госпитализаций при «индийском» штамме вдвое выше, чем при «британском»; он заразнее остальных штаммов на 60% (1 заболевший может заразить 5-6 человек, а не 3-4, как раньше); инкубационный период сократился до 7 дней.
По словам врача-инфекциониста Светланы Малиновской, схему лечения приходится постоянно менять, потому что прежние уже не работают на пациентах с «Дельтой».
«Люди поступают, мы отслеживаем их показатели и видим, с какой невероятной скоростью происходит изменение крови буквально за часы. Количество тромбоцитов увеличивается в геометрической прогрессии, у человека моментально возникает тромбоз сосудов. И сразу происходит инфаркт», — рассказала она.
Чем обусловлено такое коварство этого штамма коронавируса, объяснил директор НИЦ эпидемиологии и микробиологии имени Гамалеи Александр Гинцбург: он не разрушает клетки, а распространяется, переходя из одной клетки в другую, образуя многоядерные клетки. Тем самым, когда он уже проник внутрь, он становится очень устойчив к антителам, которые циркулируют в крови.
Малиновская образно описала «Дельта»-штамм как преступника, который поменял внешность с помощью пластической операции, но отпечатки пальцев у него остались теми же. Необратимо? Потерю обоняния и памяти при COVID-19 объяснили разрушением мозга
Однако это ещё не всё — вирусологи обнаружили новые разновидности этого штамма (B.1.617.2.1 «дельта плюс») в индийских городах Нави-Мумбаи, Ратнагири и Палгаре, власти пытаются сдержать его распространение, изолируя районы, где есть заболевшие.
По итогам исследования этой мутации вируса Индийский консорциум по геномике SARS-CoV-2 отнёс его к числу «вызывающих беспокойство», а Министерство здравоохранения Индии назвало его характеристики: повышенная проницаемость, более сильное связывание с рецепторами клеток лёгких, возможное снижение ответа на моноклональные антитела.
Из-за того, что этот штамм вызывает резкое повышение количества тромбоцитов в крови, возникает риск инфаркта, а также микротромбозов, которые впоследствии провоцируют гангрену и грозят ампутацией конечностей.
Как выявить индийский штамм?
Однако есть и нехарактерные для предыдущих штаммов коронавируса симптомы: боли в животе, диарея, тошнота, рвота, насморк, обильные выделения из носа (как при риновирусе), боли в мышцах, быстрая утомляемость, чувство подавленности и уныния. Кроме того, пациенты жалуются на нарушения слуха.
Кроме того, отметила заместитель директора по клинико-аналитической работе ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора Наталья Пшеничная, в некоторых случаях изменение основных симптомов может быть связано с одновременным заражением человека двумя вирусами.
«Это может быть и микст-инфекция, например, сочетание риновирусной инфекции, сопровождающейся обильными выделениями из носа, и COVID-19», — уточнила она.
При появлении симптомов респираторной инфекции, расстройстве желудочно-кишечного тракта и повышении температуры Пшеничная посоветовала оставаться дома и сдать тест на коронавирус. Комаровский объяснил, как победить цитокиновый шторм при коронавирусе
Как защититься от индийского штамма?
«Что касается эффективности вакцин, мы знаем, что в отношении всех вариантов, вызывающих беспокойство, включая вариант «Дельта», вакцины остаются эффективными против тяжёлых форм заболевания и смертности», — заявила руководитель технической группы подразделения чрезвычайных заболеваний ВОЗ Мария Ван Керкхове.
Однако необходимо получить обе дозы препарата.
По предварительной оценке британских учёных, западные вакцины защищают от индийского штамма на 33% после первой дозы и на 81% — после второй. Исследование НИЦ эпидемиологии и микробиологии имени Гамалеи показало, что «Спутник V» более эффективен против «дельта»-коронавируса, чем другие препараты, изученные для борьбы с этим штаммом.
Тем не менее, просто переболеть или сделать прививки в случае с индийским штаммом уже недостаточно — иммунитет для противостояния ему должен быть вдвое сильнее, чем в случае с уханьским, поэтому важно следить за уровнем антител в организме. Получить необходимые показатели, в том числе переболевшим и вакцинировавшимся ранее, поможет ревакцинация «Спутником Лайт» (по сути это 1-й компонент «Спутника V»). Врачи рассказали, когда нужно прививаться переболевшим коронавирусом
Разработчики «Спутника V» в ближайшей перспективе обещали представить дополнительную инъекцию, разработанную специально против индийского штамма и близких ему вариаций коронавируса.
Если предотвратить заболевание всё-таки не удалось, прежде всего следует самоизолироваться, вызвать врача на дом, а не ходить в поликлинику и аптеку (можно воспользоваться доставкой лекарств на дом или попросить близких оставить пакет около двери). Схема лечения хорошо известная: промывание носа морской водой, обильное тёплое питьё, при наличии температуры парацетамол или ибупрофен, больше отдыха.
«Иммуномодулирующие препараты неэффективны, а также, возможно, небезопасны. Антибактериальная терапия должна назначаться строго при подтверждении бактериальных осложнений, а не в первые дни болезни «на всякий случай», — предупреждает иммунолог Мария Польнер.
Кроме того, ни в коем случае нельзя самостоятельно назначать себе препараты против образования тромбов (антикоагулянты), поскольку они повышают риск кровотечений.
Если после улучшения состояния вновь поднялась температура или на протяжении нескольких дней сохраняются одышка, боли за грудиной, лихорадка, нужно вызвать скорую помощь и решить вопрос о проведении КТ и госпитализации.
У переболевших коронавирусом в 85% возникают те или иные осложнения, поэтому всем перенесшим это заболевание через 2 месяца обязательно рекомендуется сдать коагулограмму, чтобы проверить, не повлиял ли COVID-19 на свёртываемость крови.
Пять новых штаммов коронавируса: чем опасны и чего от них ждать?
Гид по новым вариантам (штаммам) вируса, вызывающего COVID-19 и генетическим изменениям, которые могут сделать его более контагиозным и неуловимым для иммунной системы.
Когда прошлой зимой коронавирус SARS-CoV-2 ворвался в мир, ученым стало ясно, что дело плохо, но они посчитали, что вирус, по крайней мере, стабилен. Коронавирусы не мутируют так быстро, как, например, вирусы гриппа, гепатита или ВИЧ, — отчасти благодаря системе молекулярного редактирования, которую SARS-CoV-2 и родственные ему вирусы используют для предотвращения злокачественных генетических ошибок при репликации.
Но ученые были правы лишь наполовину. Вирус и правда не принес ничего хорошего — но оказалось, что и стабильностью он не отличается. С тех пор, как SARS-CoV-2 «перепрыгнул» с животных на людей, он накапливал незначительные случайные мутации: как однобуквенные «опечатки» в генетической последовательности вируса, так и вставки или выпадение более длинных фрагментов вирусной РНК. Большинство мутаций либо убивают вирус, либо никак не меняют его строение и поведение.
Но недавно было обнаружено несколько новых штаммов оригинального вируса (его также называют «вирусом дикого типа»), мутации которых, похоже, сильно влияют на его свойства, в том числе на контагиозность. Эти штаммы были обнаружены один за другим в разных географических регионах (Великобритания, ЮАР, Бразилия) и в некоторых случаях стали доминировать над штаммами, распространенными в этих регионах ранее. Одновременное появление сразу нескольких штаммов в поле зрения ученых частично объясняется улучшением технологий мониторинга случаев заражения и увеличением объемов секвенирования вирусов. Однако схожесть паттернов мутаций в новых штаммах может указывать на то, что эти изменения не случайны.
«Мы видим, как похожие мутации появляются в разных местах, — говорит Адам Лоринг, вирусолог из Мичиганского университета. — Это наводит на размышления о том, что они для чего-то нужны».
Пока что известно, что эти мутации помогают вирусу легче передаваться от человека к человеку и оставаться незамеченным иммунной системой. В январе ученые впервые сообщили, что антитела людей, переболевших COVID-19, не полностью нейтрализуют штамм вируса, обнаруженный в ЮАР. Кроме того, похоже, несколько человек, перенесших COVID-19, повторно заразились мутантным штаммом.
По последним данным, вакцины, производимые компаниями Moderna и Pfizer, скорее всего, защищают и от новых штаммов коронавируса. Разработчики «Спутника V» также заявили о его эффективности против мутировавшего вируса. Эффективность вакцин этих производителей превышает 90 %, поэтому, по мнению экспертов, даже при небольшом снижении этой цифры их все равно стоит использовать.
«Я рад, что это не лишает смысла [использование вакцин от COVID-19], но, очевидно, требует пристального внимания», — говорит Лоринг. Он добавляет, что на протяжении следующих лет компаниям, возможно, придется изменить эти вакцины и начать вводить пациентам новые их версии — подобно тому, как каждый год меняют вакцины от гриппа. Большинство вакцин вызывают намного более сильный иммунный ответ, чем естественное заражение вирусом. Во время клинических испытаний своей вакцины компания Moderna показала, что антитела, вырабатываемые после вакцинации, остаются в организме дольше, чем антитела, вырабатываемые при естественном заражении SARS-CoV-2.
по теме
Эпидемия
Вакцины, антитела, антигены. Гид по иммунологии для чайников
Ниже перечислены пять наиболее значимых штаммов коронавируса в порядке обнаружения учеными. В списке указано место первого выявления каждого из них и официальные названия штаммов или обозначения, используемые исследователями. (Разные группы исследователей используют разные способы обозначения штаммов, что вызвало путаницу. В этом списке использованы наименования, основанные на филогенетическом происхождении штаммов, но некоторые варианты вируса все равно имеют больше одного названия). Также здесь приведены важные мутации каждого штамма (названия мутаций состоят из букв и цифр, обозначающих позицию мутации в геноме вируса) и известная информация о том, что эти мутации делают.
Испания
Штамм 20A.EU1, впервые выделенный в Испании, содержит мутацию A222V в последовательности белка шипа. Шип — структура вируса SARS-CoV-2, которая связывается с рецепторами клеток ACE2 человека, помогая вирусу проникать внутрь этих клеток при заражении. Кроме того, именно с шипами связываются антитела человека, вырабатываемые для иммунного ответа на инфекцию. Лабораторные исследования показали, что человеческие антитела немного менее эффективно нейтрализуют вирусы с мутацией A222V. За несколько месяцев штамм 20A.EU1 стал доминирующим в Европе. Тем не менее эпидемиологи не наблюдали доказательств того, что этот штамм быстрее передается от человека к человеку, чем оригинальный вирус. Исследователи считают, что штамм, который на тот момент доминировал в Испании, распространился по всему континенту, когда в Европе начали ослаблять ограничения на перемещение.
Великобритания
Британские ученые наблюдали за штаммом B.1.1.7 некоторое время, прежде чем объявили в декабре, что он может передаваться как минимум на 50 % активнее, чем вирус дикого типа. Это заявление было основано на эпидемиологических данных, указывающих, что вирус нового штамма быстро распространяется среди населения, и привело к запретам на пересечение границ и усилению карантинных мер в Великобритании.
Штамм B.1.1.7 содержит 17 мутаций, некоторые из них затрагивают белок шипа. Было обнаружено, что одна из этих мутаций, N501Y, помогает вирусу прочнее связываться с рецепторами клеток ACE2. Однако пока неясно, обусловлена ли повышенная контагиозность данного штамма только этой мутацией или еще какими-либо изменениями структуры шипа.
Несмотря на первоначальное беспокойство, не было найдено подтверждений тому, что этот штамм более заразен для детей в сравнении с оригинальным, говорит Шерон Пикок, исполнительный директор Консорциума Великобритании по геномике COVID-19 (COG-UK), группы, анализирующей генетические изменения вируса. И Pfizer, и Moderna считают, что их вакцины от COVID-19 будут работать и против штамма B.1.1.7. Недавние данные из Великобритании указывают на то, что новый штамм может быть более летален по сравнению с диким типом, но это пока только предварительные результаты.
Штамм B.1.1.7 выделяется на фоне других, потому что он накопил так много мутаций. Лоринг и другие исследователи полагают, что эти мутации могли возникнуть при длительном заражении одного пациента с ослабленным иммунитетом, из-за чего организм пациента не мог побороть вирус. По словам Скотта Вивера, микробиолога из медицинского подразделения Техасского университета в Галвестоне, возможно, только некоторые из этих генетических изменений дали штамму эволюционное преимущество и позволили ему быстро распространиться по Великобритании. Остальные мутации просто остались в геноме за компанию.
Штамм B.1.351 появился в поле зрения ученых примерно в то же время, что и британский B.1.1.7. B.1.351 быстро распространился и стал доминантным вариантом вируса в ЮАР. Как и европейский штамм, B.1.351 содержит мутацию N501Y, хотя данные указывают, что два этих штамма возникли независимо друг от друга. Но ученых больше беспокоит другая мутация в африканском штамме, обозначаемая E484K. Это изменение в геноме, возможно, помогает вирусу избегать иммунного ответа и действия вакцин.
Эволюционный биолог и биоинформатик из Онкологического исследовательского центра Фреда Хатчинсона в Сиэтле Джесс Блум с командой с помощью клеток дрожжей создали серию вирусных белков-шипов, содержащих практически все из более 3800 возможных изменений в структуре, которые могут быть вызваны генетическими мутациями. Затем исследователи протестировали, насколько хорошо антитела связывались с каждым из этих видоизмененных шипов. Они обнаружили, что в результате мутации E484K и других похожих мутаций в этом конкретном участке белка антитела некоторых людей в 10 раз хуже связывались с шипами коронавируса. Команда Блума также показала, что некоторые коктейли из антител (подобные коктейли в настоящий момент тестируют фармацевтические и биотехнологические компании Regeneron и Eli Lilly) могут быть менее эффективными при наличии мутаций, которые имеются в штамме B.1.351.
В конце января ученые из ЮАР опубликовали препринт (научная статья, которая еще не прошла независимую рецензию), в котором показали, что сыворотка крови пациентов с COVID-19, содержащая антитела, значительно менее эффективно могла нейтрализовать новый штамм. В другом препринте, опубликованном 26 января, ученые сообщают, что они добавили вирус B.1.351 в сыворотку крови, взятую у людей, которым ранее ввели вакцину производства Pfizer или Moderna. В результате антитела в такой сыворотке проявляли сниженную нейтрализующую активность по отношению к мутантному вирусу в сравнении с вирусом дикого типа.
Однако антитела в пробирке — не то же самое, что вакцина в организме живого человека. В результате применения любой из упомянутых вакцин организм производит столько антител, что даже при сниженной активности их может быть достаточно для нейтрализации вируса. Вакцины также запускают работу других защитных механизмов иммунной системы. Тем не менее Moderna начала разработку бустерной вакцины, специфичной по отношению к новым штаммам.
Бразилия
В январе ученые сообщили об обнаружении двух новых вариантов коронавируса в Бразилии, происходящих от общего предка. Но хотя у этих двух штаммов есть общие мутации с вариантами, обнаруженными в других регионах, по всей вероятности, они возникли независимо.
Из этих двух штаммов ученых больше беспокоит P.1. Он содержит больше мутаций, чем Р.2 (хотя оба штамма имеют мутацию E484K), и уже был обнаружен в Японии и других странах. Возможно, Р.1 накопил свои мутации в организме пациента с ослабленным иммунитетом. Но генетик Эмма Ходкрофт из Бернского университета в Швейцарии говорит, что в этом случае может быть сложнее определить точное время и место возникновения штамма, поскольку в Бразилии секвенируют гораздо меньше образцов вируса, чем в Великобритании.
Ходкрофт отмечает, что в 2020 году и в Бразилии, и в ЮАР были крупные вспышки COVID-19. При таком большом количестве зараженных людей, вырабатывающих антитела к вирусу, штамм, способный избегать распознавания иммунной системой и повторно заражать уже переболевших людей, мог иметь значительное преимущество и широко распространиться в популяции.
Распространение и изменение вирусов
Хотя кажущееся внезапным появление нескольких вариантов белка шипа является причиной для беспокойства, по словам исследователей, пока нет доказательств, что коронавирус претерпел какие-либо принципиальные изменения, позволяющие ему мутировать быстрее. По мнению Лоринга, более вероятно, что большое число заражений COVID-19 по всему миру предоставляет вирусу множество возможностей для постепенных небольших изменений. Каждый зараженный человек — это, по сути, дополнительный шанс для возникновения нового штамма SARS-CoV-2. «Это имеет отношение к эволюции, но в первую очередь — это вопрос эпидемиологии», — говорит Лоринг. В целом «вирус совершенствуется в своей роли».
