Анализ микробиоты по Осипову (биотоп пристеночная микробиота «Толстая кишка») в Ульяновске
Анализ направлен на определение состава микробиоты, обитающей на слизистой оболочке толстой кишки. Исследование является одним из методов выявления изменений кишечной флоры и оценки ее восстановления на фоне терапии пробиотиками.
Приём и исследование биоматериала
Когда нужно сдавать анализ Анализ микробиоты по Осипову (биотоп пристеночная микробиота «Толстая кишка»)?
Подробное описание исследования
Бактерии доминируют среди представителей кишечной микробиоты. Выделяют эубиотические и условно-патогенные виды бактерий. Эубиотические бактерии рассматриваются как полезные. Они преобладают в здоровом кишечнике, где участвуют в следующих процессах:
В меньшем количестве в кишечнике обнаруживаются условно-патогенные бактерии. Они поддерживают разнообразие микробиома, что также важно для здоровья.
Неправильное питание, заболевания желудочно-кишечного тракта, прием некоторых антибиотиков нарушает состав микробиоты кишечника. Численность полезных бактерий уменьшается, в то же время наблюдается избыточный рост условно-патогенных микроорганизмов.
Это состояние называют «дисбиоз» (более раннее название «дисбактериоз»). При незначительном нарушении состава микрофлоры толстой кишки описанные изменения незаметны для человека. Увеличение численности условно-патогенной пристеночной микрофлоры приводит к нарушению пищеварения, синтеза витаминов, обмена веществ. Это проявляется в виде вздутия живота, повышенного газообразования, нарушения стула. Длительное изменения микробного состава толстой кишки вносит вклад в повышение риска некоторых заболеваний, например рака кишечника.
Ранее стандартным тестом на нарушение состава микробиоты толстой кишки был посев кала на питательные среды. В связи с тем, что не все виды бактерий могут быть обнаружены подобным методом и большими сроками получения результатов, сейчас данный анализ используется не так широко.
Нашим соотечественником, профессором Г.А. Осиповым, был разработан метод, позволяющий определить состав микрофлоры по наличию белков бактерий в биологическом образце. Для каждого вида микроорганизмов выделен характерный спектр белков.
Анализ микробиоты по Осипову (биотоп «Тонкая кишка») в Черкесске
Идентификация состава микрофлоры кишечника с помощью определения содержания жирных кислот, выделяемых бактериями, в сыворотке крови.
Приём и исследование биоматериала
Когда нужно сдавать анализ Анализ микробиоты по Осипову (биотоп «Тонкая кишка»)?
Подробное описание исследования
Микрофлора (микробиом) кишечника играет огромную роль в поддержании здоровья человека. Бактерии, входящие в ее состав, способствуют расщеплению пищи, влияют на метаболизм всего организма, регулируют иммунитет, синтезируют необходимые витамины. Многие из этих функций микрофлора осуществляет посредством выделения особых веществ — жирных кислот, которые затем попадают в кровоток.
Предположительный состав нормальной микрофлоры предложен учеными, но продолжаются активные исследования в этой области. Данный состав может различаться в некоторых пределах, а также изменяться в зависимости от питания, климатических условий, психического состояния человека.
Нарушение композиции кишечного микробиома из-за неправильного питания, приема антибиотиков и некоторых других лекарств, заболеваний желудочно-кишечного тракта негативно отражается на его функциональных способностях. Это приводит к нарушению обмена веществ, снижению иммунитета и другим проблемам со здоровьем.
Среди обитателей кишечника встречаются аэробы, то есть бактерии, способные жить и размножаться при наличии кислорода. Однако большинство микроорганизмов являются анаэробами и не выживают при доступе кислорода. Ввиду этого ранее широко применявшиеся методы посева на питательные среды образцов, полученных из кишечника, не дают полного представления о составе микробиома и тем более о его функциях.
Эти недостатки позволил устранить анализ микробиоты по Осипову. В основе исследования лежат такие методы, как масс-спектрометрия и газовая хроматография. Использование современных приборов позволяет с большой точностью определить содержание жирных кислот, которые выделяют микроорганизмы, и посредством анализа данных оценить состав кишечного микробиома.
Преимущество метода состоит в выявлении широкого спектра обитателей кишечника, среди которых многие живут только в бескислородной среде (анаэробы).
Анализ микробиоты по Осипову является удобным и универсальным методом выявления дисбиоза. Он может выполняться в том числе в рамках контроля изменений микрофлоры при лечении заболеваний кишечника.
Метод назван в честь профессора Г.А. Осипова, впервые предложившего его для изучения состава микробиома.
Особенности и преимущества методики
Газовый хроматограф с масс-спектрометрическим детектором, производитель «Agilent Technologies» (США).
Как читать анализ по Осипову. Часть 1
В этой статье мы подробно разберем первую страницу результатов анализа по Осипову. Поехали!
Итак, вы сдали анализ микробных маркеров и получили большую таблицу. На первый взгляд она непонятна, вызывает много вопросов и порой ужасает пациентов и специалистов. Но это только на первый взгляд. Если вы еще не сдали анализ по Осипову и хотите посмотреть, как выглядят результаты, то вы на верном пути.
Что показывает эта загадочная таблица и как “читать” анализ методом ГХМС, рассказываем дальше.
Бланк лабораторного исследования
Перед вами бланк лабораторного исследования, в котором представлены данные о 58 микроорганизмах. Именно так выглядит первая страница результатов оценки тонкого кишечника методом газовой хромато-масс-спектрометрии (ГХМС). Что же мы видим в таблице?
“Что это за голубые и розовые пометки на бланке анализа?” Все очень просто. Это обозначения, которые облегчают жизнь специалисту-диагносту. При внушительном увеличении количества того или иного микроорганизма, его окошко выделяется розовым цветом, а дефицит окрашивается голубым. Таким образом, просто бросив взгляд на бланк, можно увидеть картину избыточного или дефицитного состояния по тому или иному микроорганизму.
Ну вот и все! Мы с вами подробно разобрали первую страницу результатов анализа по Осипову. Разбор второй страницы читайте тут.
Смотрите полную версию разбора анализа микробных маркеров от ведущего специалиста лаборатории ГенОм Шароновой Дианы Александровны.
Анализ микробиоты по Осипову (биотоп «Эндометрий») в Москве
Качественный и количественный анализ микробиоты (сообщества микроорганизмов) слизистой оболочки матки (эндометрия) с помощью высокоточного метода масс-спектрометрии специфических микробных маркеров. Исследование позволяет выявить природу и характер воспалительных процессов, инфекций, дисбиозов эндометрия и оценить степень отклонения его микробного состава от нормы. Анализ позволяет охватить максимальное количество микроорганизмов различных групп: бактерий, вирусов, грибковых инфекций.
Приём и исследование биоматериала
Когда нужно сдавать анализ Анализ микробиоты по Осипову (биотоп «Эндометрий»)?
Подробное описание исследования
Микрофлора, или микробиота, — это совокупность микроорганизмов, находящихся в определенных участках организма человека. Такие участки, однородные по среде и населяющим их микроорганизмам, называются биотопами. Эндометрий в норме населяет определенный набор микроорганизмов, выполняющих роль иммунной защиты от патогенных и условно-патогенных бактерий. Особенно важна роль миклофлоры эндометрия при планировании и во время беременности. Нормальная микробиота эндометрия здоровой женщины может содержать огромное количество видов бактерий.
В отличие от биотопа нижних половых путей (влагалища и цервикального канала), где основную роль играют лактобактерии, в эндометрии лактобациллы составляют лишь около 30% биотопа. Микрофлору составляют следующие микроорганизмы: Pseudomonas, Acinetobacter, Vagococcus, Sphingobium и многие другие, в том числе условно-патогенные. В отличие от влагалища, слизистой оболочке матки присуща более щелочная среда, что и отражается на составе эндометриального микробиома. При нарушении баланса микрофлоры, например, при значительном снижении количества лактобацилл, происходит нарушение защитных механизмов микрофлоры. Такое изменение ведет к созданию благотворных условий для жизнедеятельности условно-патогенных организмов и соответственно к развитию воспалительных заболеваний.
Микробиота в последнее время все чаще рассматривается в качестве интегрального показателя состояния организма или отдельного органа, которое может изменяться под воздействием различных факторов. С помощью анализа микробиоты возможно осуществлять ее восстановление в случае нарушения и контролировать состояние всего организма.
Нарушение баланса микробиоты эндометрия часто связано с нарушением нормального функционирования слизистой оболочки матки, что отражается в развитии патологических процессов, персистирующих (хронических) инфекций, длительных воспалений, таких как хронический эндометрит, которые в конечном итоге могут приводить к бесплодию.
Анализ микробиоты по Осипову основан на качественном и количественном определении специальных микробных маркеров — высших жирных кислот (ЖК) фосфолипидов и липополисахаридов. Эти вещества либо присутствуют в клеточных стенках микроорганизмов, либо выделяются ими в процессе жизнедеятельности. Каждому роду и виду бактерий, вирусов и грибков присущи определенные наборы этих маркеров, по присутствию и количеству которых можно определить полный состав микробиома. Такие маркеры отличаются от веществ, присущих клеткам человека. Например, в клетках человеках содержится более 20 видов жирных кислот, в то время как у микробов их более 200 видов.
Для определения микробных маркеров используется высокочувствительный метод газовой хроматографии с масс-спектрометрией (ГХ-МС). В ходе анализа определяется более 56 микроорганизмов одновременно, без использования длительных технологий высевания и очистки.
Анализ микробиоты по Осипову является удобным и универсальным методом выявления дисбиоза. Он может выполняться в том числе в рамках контроля изменений микрофлоры при лечении гинекологических заболеваний.
Метод назван в честь профессора Г. А. Осипова, впервые предложившего его для изучения состава микробиома.
Определение микробиоценоза методом хромато-масс-спектрометрии (МСММ)
Описание
Метод масс-спектрометрии микробных маркеров (МСММ) — применяют для изучения микроэкологии человека. Метод предлагает качественно новый вариант микробиологического исследования, благодаря возможности одновременного количественного определения большого количества микробных маркёров, непосредственно в биологических пробах без культивирования микроорганизмов. Получение в реальном времени расширенной информации об анаэробах и трудно культивируемых аэробах, а также актинобактериях, вирусах, дрожжах и микроскопических грибах из одной пробы — обеспечивает полное понимание микробной этиологии заболевания. В дополнение, количественные измерения позволяют изучать динамику изменения микробиоты при лечебных мероприятиях, в том числе — влияние антибиотиков и пробиотиков на пристеночную микробиоту кишечника.
Уникальность метода
Сущность анализа состоит в прямом извлечении с помощью химической процедуры высших жирных кислот, альдегидов, стеринов из образца, подлежащего исследованию (например, биоптата кишечной стенки или крови), их разделения на хроматографе в капиллярной колонке высокого разрешения и анализа состава в динамическом режиме на масс-спектрометре. Состав маркёров микроорганизмов видоспецифичен и используется для их идентификации в чистой культуре. Кроме того, у многих микробов имеются индивидуальные маркёры, специфичные для таксонов разного уровня (семейства, рода или вида), по которым их можно определять количественно в клинических пробах.
Стандартный набор проб для исследования:
1. Аспират из матки.
2. Биоптат тканей.
3. Бронхоальволярный лаваж.
4. Вагинальное содержимое.
5. Дренаж.
6. Кровь.
7. Ликвор.
8. Мазок из зева.
9. Мазок из уретры.
10. Мазок из уха.
11. Моча.
12. Отделяемое глаза.
13. Отделяемое носа.
14. Раневое отделяемое.
15. Секрет простаты.
16. Слюна.
17. Смыв трахеи.
18. Соскоб кожи.
19. Фекалии.
20. Мазок из цервикального канала.
21. Эякулят.
22. Другие пробы при необходимости.
Метод может использоваться не только для поиска инфекции, но и для оценки общего состояния микробиоты человека.
Широчайший спектр применения методики:
1. Отделения реанимации и
интенсивной терапии.
2. Хирургические отделения.
3. Кардиологические отделения.
4. Гинекологические отделения.
5. Урология и андрология.
6. Отделения репродукции и
планирования семьи.
7. Дерматовенерология.
8. Пульмонология.
9. Гепатология.
10. Отделение гастроэнтерологии.
11. ЛОР-отделения.
12. Иммунология и генетика.
Подготовка к исследованию
Рекомендуется сдавать кровь утром натощак. Или не ранее, чем через 2–4 часа после приёма пищи. Можно пить простую воду без газа и сахара.
Перед сбором пробы необходимо провести тщательный туалет наружных половых органов и области заднего прохода, промыв их под душем с мылом. Женщинам не рекомендуется сдавать анализ во время менструации.
Разовую порцию мочи получают при мочеиспускании, при этом отбирается средняя порция мочи в стерильный одноразовый пластиковый контейнер без ложки (СК).
Обращаем внимание, что для мочи не предусмотрены нормы, так как данный биоматериал является в норме стерильным.
Кал
Стул должен быть получен без применения клизм и слабительных.
Предварительная подготовка состоит из употребления пищи, сбалансированной по содержанию белков, жиров и углеводов.
Материал для исследования отбирают из средней части фекальной массы специальной ложечкой, вмонтированной в крышку универсального стерильного пластикового контейнера в количестве, равном объему мерной ложки без горки. При заборе материала следует избегать попадания мочи и отделяемого половых органов.
Обращаем внимание, что для кала не предусмотрены нормы по причине нестабильности состава данного биоматериала.
Эякулят
Анализ сдают после полового воздержания. Рекомендуемый срок воздержания 2–7 дней. В период подготовки нельзя употреблять алкоголь в любых количествах. За 7–10 дней необходимо исключить приём лекарственных препаратов, процедуры с перегреванием (УВЧ, сауна, баня). В день, предшествующий выполнению анализа, желательно исключить тяжёлые физические и психологические нагрузки.
После выполнения массажа простаты должно пройти не менее 3-х дней.
Если в период подготовки были простудные или другие острые заболевания, сопровождавшиеся подъёмом температуры, стоит отказаться от выполнения исследования.
Слюна
Сбор слюны производится в стерильный контейнер сплевыванием накопившейся в течение 2 минут во рту слюны (пациент сидит с опущенной головой, не двигает языком и губами) — процедура повторяется 2–3 раза в один контейнер. Общее время сбора — 6 минут.
Собирается за 2 часа до еды или утром до чистки зубов.
Секрет простаты
Материал собирается пациентом после массажа предстательной железы квалифицированным врачом-урологом.
Мазок из урогенитального тракта
Материал для исследования берётся до проведения мануальных исследований, до начала антибактериальной терапии или не ранее двух-трех недель после её окончания.
Если материал забирают из урогенитального тракта женщины, то исследование не проводится во время менструации. В течение 24 часов перед обследованием не следует проводить спринцевание; исключить интравагинальную терапию, половой акт.
Если материал забирают из урогенитального тракта мужчины, то мазок забирают спустя 2 часа после последнего мочеиспускания.
Мазок из зева
Материал для исследования берется до начала антибактериальной терапии или не ранее двух-трех недель после её окончания.
Из зева собирают материал не ранее, чем через 2 часа после приёма пищи, лучше утром до чистки зубов.
Перед исследованием, за сутки, исключить местную антисептическую терапию.
